RDkit 첫 사용

chemical의 다양한 포맷을 rdkit이라는 것을 사용해서 다룰 수 있다. 대표적인 chemical의 포맷들은 - SMILES - MOL2 - SDF 위의 포맷들이 있으며, rdkit과 openbabel등을 이용하면 쉽게 컨트롤 할 수 있다. 우선 rdkit을 설치해보자. 필자와 같은 경우에는 python을 사용하여 다루는 일이 많고, anaconda(miniconda)를 애용하기 때문에 conda에서 설치해서 사용하는 방법을 소개한다. conda install -c conda-forge rdkit 위의 커맨드로 설치가 가능하다. 또는 conda install -c rdkit rdkit 채널을 이렇게 설정해서 설치가 가능하다. 위의 적힌 포맷들을 (SMILES,SDF,MOL2)를 rdkit에서 어떻게 읽을지 소개해보도록 하겠다. from rdkit import Chem 우선 위의 커맨드로 Chem class를 import 해주도록 한다. # input format : SMILES...

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