메타지노믹스의 연구_ 샘플파쇄의 중요성

미생물 군집 분석을 위해 metagenomics DNA를 분리할 때, 가장 중요한 것은 원래의 군집 구조를 그대로 반영할 수 있는 metagenomics DNA를 추출하는 것입니다. 아래 천연구소 (CHUN LAB)의 샘플 프렙 가이드 'Meta-genomic DNA Preparation for Microbial Community Analysis'에 보면, 샘플 프렙의 중요사항과 주의사항이 잘 설명 되어 있습니다. DNA를 추출할 때 효소를 이용하여 샘플의 파쇄도 가능하지만, 그람 양성과 그람음성의 세포벽 구조차이로 인해, DNA 추출효율의 차이가 발생할 수 있습니다. 다시 말해 원래의 군집구조가 그대로 추출되는게 아니라, 추출효율에 따라 군집구조가 왜곡될 수도 있음을 의미합니다. 따라서, Metagenomic DNA 추출을 위해 권장되는 방법은 물리적으로 세포벽을 파쇄하는 bead beating 방법입니다. MP bio사 (www.mpbio.com) 에서는 FastDNA spin ...

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