분변 샘플 DNA 추출을 위한 전처리 (Stool Sample Processing for DNA Extraction)


분변 샘플 DNA 추출을 위한 전처리 (Stool Sample Processing for DNA Extraction)

왜 Bead Beating인가요? 분변/대변 샘플은 다양한 미생물(microorganisms), 고분자 물질 (macromolecules), 대사물 (metabolites), 비 소화물질 입자 (particulate non-digested matter) 등으로 가득차 있어서 아주 복잡한 환경입니다. 분변/대변의 구성은 호스트 (host)의 식습관과 건강 상태 등 다양한 요인에 의해 영향을 받으며, 이런 다양성 때문에 흥미로운 연구 대상이 됩니다. 이런 복잡한 샘플로 연구를 할 경우, homogenization 방법으로 모든 미생물들을 효율적으로 lysis 하여, downstream analysis에서 미생물 군집을 정확하게 나타내는것이 중요합니다. 특히 그람 양성균을 충분하게 파쇄하기 위해서는 비드비팅 (bead beating)이 필요하며, 비드비팅을 사용하지 않았을때와 비교했을때에 비해 추출된 genomic DNA의 yield와 quality를 확실히 높일 수 있습니다. 적합한 비...


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