[Python] 파이썬으로 fasta 파일 읽기

파이썬에은 다양한 방법으로 생물정보학 분석에 사용될 수 있다. 그 중 기본적으로 사용될 수 있는 fasta 파일을 읽는 방법을 알아본다. 먼저 fasta 파일은 다음과 같이 >와 함께 나오는 헤더(header)와 시퀀스로 구성되어있다. 내가 필요한 건 주로 시퀀스이기 때문에 코드를 다음과 같이 짤 수 있었다. import re with open("input.fasta") as file: f = file.read().replace("\n","").split(">") st = [] seq = [] for i in range(len(f)): st.append(f[i].replace("Rosalind_","")) st = [v for v in st if v] for i in range(len(st)): seq...

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