Gene Set Enrichment Analysis - Gene Ontology 란 GSEA 란? -용도와 해석법

RNA나 DNA 데이터들을 통계 처리까지 완료 했다면 그다음은 나온 후보 유전자들을 어떻게 해석할 것인가를 분석해야 한다. 해석하는 과정에 있어서 많이 사용하는 방법은 Gene Ontology와 Gene Set Enrichment Analysis 두가지이다. 그래서 이번편에서는 1. Gene Ontology와 GSEA가 무엇인지, 2. 두 방법의 차이점, 가능하다면 다음편에 3. Gene Ontology에 많이 사용되는 tool 'DAVID' 사용법을 공유하고자 한다. Gene Ontology란? Gene Ontology는 예를 들어 RNA-seq 데이터로 DEG 분석을 시행하여 나온 관심 유전자들이 있을 것이다. 이 유전자들을 조사할 때 생물학의 어떤 pathway에 enrich되어 있고, 어떤 기능(function)을 하는지, 혹은 어떤 protein에 localized되어 있는지 annotation을 하기 위한 단계라고 보면 된다. (어떤 pathway에 enrich가 되었음은...

원문링크 : Gene Set Enrichment Analysis - Gene Ontology 란 GSEA 란? -용도와 해석법