[BI / bedtools] bedtools란?

#bedtools 생물정보학에서 필수적으로 이용되는 BAM, BED, GFF/GTF, VCF에서 Genome intervals의 교차, 병합, 카운트 등 여러가지 기능을 제공하는 생물정보학 software. 서로 다른 Genomic invervals를 갖는 2개 이상의 파일에서 교차지역 혹인 전체 genomic intervals을 쉽게 찾을수 있어, 원하는 영역을 새로운 파일에 저장할 수 있다. 1.bedtools에 탑재된 명령어. 1) intersect 2) coverage 3) groupby 4) map 5) merge 6) overlap 7) jaccard 8) sort 9) window 10) subtract 11) random 12) links 13) complement 14) closest . . . 등등 엄청나게 많은 기능 제공. 출처 : https://europepmc.org/article/PMC/4213956 2.간단한 이해 1) bedtools intersect 출...

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