[R / 기본함수] p value 보정 함수

p-value를 보정하는 이유는 많은 유전자를 동시에 multiple testing이 되어 나오게되는 false positive를 걸러내기 위한 방법입니다. p-value에 대한 자세한 이야기보다는 R을 통해 p-value를 보정하는 방법에 대하여 설명드리겠습니다. 첨부파일 pvalue보정.txt 파일 다운로드 예시파일 예시파일을 R에서 읽어보겠습니다. Data <- read.table('pvalue보정.txt', header=T) View(Data) 위와 같은 코드를 실행하게 되면 데이터를 확인하실 수 있습니다. 데이터가 잘 읽어진 것을 확인하고 다음단계로 넘어가겠습니다. p-value를 보정하기 위해서는 R에 내장되어있는 함수인 p.adjust 함수를 이용합니다. 우선 보정하기 위한 p-value값을 pval이라는 변수에 할당을 합니다. pval <- Data$p.value FDR <- p.adjust(pval, method = 'fdr') Bonferroni <- p.adjus...

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