[BI / HOMER] HOMER란?

[BI / HOMER] HOMER란?

#HOMER HOMER (Hypergeometric Optimization of Motif EnRichment). NGS 데이터를 이용하여, Motif를 찾을 수 있는 bioinformatic tool. UNIX, Linux환경에서 작동 가능. *Unix-style operating system (UNIX/LINUX/Mac/Cygwin) *1 Gb of RAM (4+ Gb) *1 Gb of Hard Drive Space (>10Gb) *자세한 Requirements Perl, C++언어로 구성. de novo motif discovery algorithm 이용. 8~20bp(base pair)의 motif를 찾기에 적합. ChIP-Seq, GRO-Seq, RNA-Seq, DNase-Seq, Hi-C 등 다양한 NGS 데이터에 대한 기능 제공. HOMER package안에, UCSC 기반 promoter, genome, annoataion정보 존재. Accession numbers, ...

#HOMER

원문링크 : [BI / HOMER] HOMER란?

 등록된 다른 글

[BI / HOMER] HOMER란?

[공주 / 카페] 분위기 좋은 사진 맛집 공주 카페 "엔학고레"

[Excel / Cell] 비어있는 행 일괄 제거

[Journal / 11월 3일의 일상]

[Journal / 8월 13일의 일상]

[Journal / 8월 12일의 일상]

[Journal / 01월 06~08일의 일상] San francisco, One Way

[서울-성수동/ 그릭요거트] 오거트 포레스트(오거트, Oh gurt)