[Bioinformatics / Trimming, Quality Control] TrimGalore 설치, 이용, 설명


[Bioinformatics / Trimming, Quality Control] TrimGalore 설치, 이용, 설명

Adapter & Quality Trimming을 위한 TrimGalore # Trimming 이란? [BI / Trimming] Trimming에 대한 이해 및 설명 NGS Raw Data의 전처리 과정인 Trimming에 대한 간략한 이해 # Adapter란? 간단히 말해 NGS Seq... blog.naver.com 이전에 Trimming의 개념에 대한 글을 참고. # TrimGalore란? High-throughput sequencing data에서 adapter를 trimming 하고 qualirt check을 할 수 있는 Bioinformatic software. Python 기반으로 만들어진 tool이며 Window, Mac, Linux에서 사용 가능. Tool을 이용하기 위해 "Cutadapt", "FastQC" tool이 먼저 설치되어 있어야 함. FASTQ 파일을 input 파일로 사용하며 Cutadapt를 이용하여 adapter와 quality를 trimming ...


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